中國在農業上運用不少農藥，環境污染已構成社會性的疑問。臭氧具有強氧化力與滅菌作用，作為避免藥害及環境污染的一個手法正在各行業得以運用，如設備園藝（營養液培養），種子育苗，保鮮等的滅菌消毒，別的低濃度的處置以推進發芽、成長也較得作用。因為農業觸及諸因子之復雜性，同樣是臭氧，因濃度與處置辦法的不一樣，對植物及生命體的影響也具有徹底不一樣作用。
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臭氧氣體用于設備內植物，能有用防治暖棚中西紅柿、香瓜、黃瓜的霜霉病、灰霉病等，并能去掉茄子、蘑菇類、盆花等的霉雜菌及蚜蟲，還有推進成長之作用。小型溫室只需裝一臺，在通路上方布管可到達極好分散作用。氧水用于大棚滴灌臭氧水滴灌可驅除營養液中藻類，也可用于營養液病害的殺滅。因選用根部浸漬培養時，濃度在0.1MG/L以上會有危害，所以可在休閑期對營養液處置，或許以循環方法，即在營養液回流儲存罐時，寫入臭氧的間歇方法滅菌。例：單棟溫室，350平方，均高2米。12-3月間運用臭氧機，每1-2天開機一次，每次60分鐘對空氣凈化，一起每3天往水箱中吹臭氧，100升的水箱曝氣20分鐘。經臭氧處置的大棚菜的情況：臭氧噴霧防治空氣傳染性病菌選用抗葉霉病較弱的西紅柿種類，設4個試驗區進行菌接種；
1）噴霧后批改濃度為0.3mg/l的臭氧水噴霧區
2）百菌清農藥700倍稀釋的農藥噴霧區
3）蒸餾水噴霧區
4）無接種無噴霧對照區。
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現在國內在農業上比較常見的使用臭氧技術是在溫室大棚，臭氧常用于以下方面：
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一、種子處理。臭氧是一種強氧化劑和廣譜高效殺菌劑，將臭氧氣體導入清水中并不斷攪拌，10分鐘后即制得臭氧溶液。將種子倒入其中浸泡15-20分鐘，可殺滅種子表面的病毒、病菌及蟲卵。另外低濃度的處理以促進發芽、生長也較得效果。
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二、臭氧因濃度與處理方法的不同，對植物及生命體的影響也具有完全不同效果。臭氧氣體用于棚內植物能有效防治棚中番茄、香瓜、黃瓜的霜霉病、灰霉病等，并能去除茄子、蘑菇類、盆花等的霉雜菌及蚜蟲，還有促進生長之效果。
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三、對溫室大棚做殺菌消毒凈化。通常使用熏棚法對溫室大棚進行殺菌消毒凈化。
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四、園藝花卉種植中，使用臭氧的殺菌、凈化作用對花卉保鮮殺菌消毒。用臭氧發生器制成臭氧水，用于大棚滴灌臭氧水滴灌可驅除營養液中藻類，也可用于營養液病害的殺滅。因采用根部浸漬栽培時，濃度在0.1MG/L以上會有損害，所以可在休閑期對營養液處理，或者以循環方式，即在營養液回流儲存罐時，注入臭氧的間歇方式殺菌效果好。
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五、制造利用臭氧水。使用臭氧水對農作物進行噴淋、滴管等達到對病蟲害、致病菌的預防、治療，從而減少對農藥的使用。
